Para esta actividad decidí hacer uso de mi experiencia profesional previa para definir un tema de estudio y, en el cual, se pudiera aplicar métodos propios del programa al que deseo incorporarme en la UnADM (Lic. en Matemáticas).
Más adelante dejo la información sobre el plan de trabajo para esto:
1. Bu scar
en la literatura genes candidatos a estudiar y que se encuentren asociados con
la latencia y la reactivación de M.
tuberculosis.
Más adelante dejo la información sobre el plan de trabajo para esto:
Tema
Análisis de
la expresión genética de Mycobacterium tuberculosis
latente durante la infección de macrófagos humanos.
Objetivo general
Analizar la expresión
de tres genes de Mycobacterium
tuberculosis, involucrados en la latencia y la reactivación, durante la
infección de macrófagos humanos con bacilos latentes.
Objetivos
específicos
2. Recopilar
datos experimentales sobre la expresión de los genes en estudio durante la
infección de macrófagos humanos.
3. Evaluar
la expresión absoluta de los genes en estudio mediante un modelo matemático.
4. Evaluar
la expresión diferencial de los genes en estudio durante las distintas
condiciones de infección.
5. Analizar
mediante un método estadístico los resultados obtenidos de la expresión, tanto
global como diferencial.
Tipo de
investigación
Básica, transversal y cuantitativa con datos secundarios
(obtenidos de la literatura) y experimentales.
Metodología
- Buscar en bases de datos, como el NCBI, referencias bibliográficas sobre los genes micobacterianos más estudiados.
- Recopilar los datos experimentales publicados sobre la expresión de los genes seleccionados durante la infección de los macrófagos con bacilos latentes (fase NRP1 y NRP2) y con bacilos activos (fase Log). Se recopilarán datos preferentemente obtenidos por la técnica de la Reacción en Cadena de la Polimerasa cuantitativa (qPCR).
- Evaluar la expresión absoluta de los genes mediante su normalización con los datos del gen constitutivo rrs.
- Determinar la expresión diferencial al comparar los datos obtenidos de las diferentes condiciones de infección, particularmente las comparaciones: NRP1/Log, NRP2/Log y NRP1/NRP2Analizar los datos mediante el método One-way ANOVA con la prueba de Tukey (p<0.05) en el programa SigmaStat 3.5.
Materiales
requeridos
·
Acceso
a internet
·
Equipo
de cómputo
·
Programa
SigmaStat 3.5
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Espero sus dudas o comentarios.
Saludos ;)
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