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Sesión 4. Anteproyecto de investigación

Para esta actividad decidí hacer uso de mi experiencia profesional previa para definir un tema de estudio y, en el cual, se pudiera aplicar métodos propios del programa al que deseo incorporarme en la UnADM (Lic. en Matemáticas).

Más adelante dejo la información sobre el plan de trabajo para esto:


Tema

Análisis de la expresión genética de Mycobacterium tuberculosis latente durante la infección de macrófagos humanos.

Objetivo general

Analizar la expresión de tres genes de Mycobacterium tuberculosis, involucrados en la latencia y la reactivación, durante la infección de macrófagos humanos con bacilos latentes.

Objetivos específicos

 1. Buscar en la literatura genes candidatos a estudiar y que se encuentren asociados con la latencia y la reactivación de M. tuberculosis
2.  Recopilar datos experimentales sobre la expresión de los genes en estudio durante la infección de macrófagos humanos. 
3. Evaluar la expresión absoluta de los genes en estudio mediante un modelo matemático. 
4.   Evaluar la expresión diferencial de los genes en estudio durante las distintas condiciones de infección.
5.  Analizar mediante un método estadístico los resultados obtenidos de la expresión, tanto global como diferencial.


Tipo de investigación

Básica, transversal y cuantitativa con datos secundarios (obtenidos de la literatura) y experimentales.

Metodología

  1. Buscar en bases de datos, como el NCBI, referencias bibliográficas sobre los genes micobacterianos más estudiados.
  2. Recopilar los datos experimentales publicados sobre la expresión de los genes seleccionados durante la infección de los macrófagos con bacilos latentes (fase NRP1 y NRP2) y con bacilos activos (fase Log). Se recopilarán datos preferentemente obtenidos por la técnica de la Reacción en Cadena de la Polimerasa cuantitativa (qPCR).
  3. Evaluar la expresión absoluta de los genes mediante su normalización con los datos del gen constitutivo rrs.
  4. Determinar la expresión diferencial al comparar los datos obtenidos de las diferentes condiciones de infección, particularmente las comparaciones: NRP1/Log, NRP2/Log y NRP1/NRP2Analizar los datos mediante el método One-way ANOVA con la prueba de Tukey (p<0.05) en el programa SigmaStat 3.5.

Materiales requeridos

·         Acceso a internet
·         Equipo de cómputo
·         Programa SigmaStat 3.5
_                         ________________________________________

      Espero sus dudas o comentarios.

      Saludos ;)



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